Ganz banal gefragt...wo sind denn da die Vor- bzw. Nachteile?
Wenn man sich die Teile mal genauer anschaut, gibt es gar nicht so viele Unterschiede, weil viele Komponenten sehr ähnlich und von den gleichen Zulieferern sind. Das sind z.B. Gasarmatur, Gebläse, Regelung und ähnliche. Die sollte man bei einem Vergleich eher außen vor lassen; insbesondere wenn es um Lebensdauer-/Robustheitsbetrachtungen geht. Die wesentliche Unterschiede liegen daher bei Aufbau (Wärmetauscher, Kesselinhalt und inkludierte Komponenten), technischen Daten (Effizienz / Mindestleistung) und Preis.
Kessel sind meist nackt, müssen also mit externen Komponenten (Pumpen, Ventile usw.) ergänzt werden, haben in der Regel einen hohen Wasserinhalt (z.B. 50l statt 2-4l bei Thermen), gibt es nicht mit den guten Modulationswerten (Mindestleistung) von (Top)Thermen, brauchen mehr Platz und Montageaufwand und sind häufig schon als Grundgerät teurer (und brauchen dann noch die ext. Teile). Thermen kommen dagegen 'all inclusive' und können in vielen Fällen direkt und ohne weitere Sachen eingesetzt werden.
Wegen des hohen Kesselinhalts und der freien Wahl der Heizungspumpe sind Kessel in entsprechenden Anlagen (große Häuser/MFH, viel FBH u.a.) einfacher und unproblematischer einsetzbar. Der Kessel verzeiht mehr (inkl. unfähige Heizungsbauer) und ist zudem weniger taktempfindlich bzw. taktet mit niedrigerer Frequenz bei gleicher Mindestleistung. Allerdings verursacht der Kessel potenziell höhere Verluste, wenn es um Warmwasser außerhalb der Heizperioden geht. Bei Thermen, die meist eine nicht so starke Umwälzpumpe haben, ist die Hydraulik kritischer und es muss ggf. mit zusätzlichem Aufwand nachgeholfen werden (z.B. hydraulische Weiche), damit die Anlage vernünftig läuft. Generell haben hydraulische bzw. Installationsfehler bei Thermen größere negative Auswirkungen.
Aber das war es eigentlich schon. Es ist zwar immer wieder die Rede von der größeren Robustheit und Langlebigkeit von Kesseln. Aber grundsätzlich sehe ich das nicht und hier wurden auch noch keine wirklich überzeugenden Argumente dafür - im Vergleich zu einer gut dimensionierten und installierten Therme - gebracht. Aber vielleicht meldet sich ja noch jemand dazu - mit richtigen Fakten und sachlichen Argumenten.